Molby - A Molecular Modeling Software

Fork

バージョン 0.6.5 を公開しました。

新機能 ・GAMESS を子プロセスとして実行できるようになった。 ・X線データについて、結合距離・結合角を標準偏差つきで計算する機能を実装。 ・GAMESS で F, G 型の軌道を含むログをインポートできるようになった（cube の計算は未実装） ・GAMESS エキスポートのダイアログで、基底関数系をファイルから読み込めるようになった。 ・Particle mesh Ewald 計算を実装（試験的に）。 ・"Pi アンカー" 原子を実装（試験的に）。シクロペンタジエニルと金属の結合などに使う。 ・Ruby コンソールにヒストリ機能を実装。

バグ修正 ・古い TeXsan で生成した CIF ファイルが読めなかったのを修正。 ・CIF ファイルデータの対称操作による拡大の不具合改善（まだ不十分かも）。 ・結合を削除するとバスエラーが発生していたのを修正。 ・異なる２つの原子を別々にドラッグするとアンドゥが機能していなかったのを修正。 ・分子の追加・削除機能を大幅書き直し。アンドゥの不具合が改善した。 ・その他多くの不具合修正。

Version 0.6.5 is out. New Features: Local execution of GAMESS is implemented. For X-ray data (with standard deviations), calculation of bonds and angles with standard deviation is implemented. GAMESS log containing F and G type orbitals can now be imported (cube calculation is not yet implemented). In the 'GAMESS export' dialog, new basis sets can be loaded from external files. Particle mesh Ewald calculation is implemented (experimentally). "Pi-anchor" atoms (i.e. dummy atoms for cyclopentadienyl-metal bonds etc.) are implemented (experimentally). The Ruby console now has history capability.

Bug Fix: CIF files from old TeXsan software cannot be loaded. Fixed. Symmetry expansion in CIF import is improved (may not be complete yet). Deleting bonds was causing bus error. Fixed. Two subsequent dragging of different atoms was causing undo failure. Fixed. Merging/unmerging molecules are revised, so that undo works more consistently. And many others.